Александра Олеговна Голубева, младший научный сотрудник, лаборатория бактериальных инфекций
680610, г. Хабаровск, ул. Шевченко, 2
Aleksandra O. Golubeva, Junior Staff Scientist, Laboratory of Bacterial Infections
2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610
Альбина Павловна Бондаренко, кандидат медицинских наук, ведущий научный сотрудник, заведующая лабораторией бактериальных инфекций, Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии
680610, г. Хабаровск, ул. Шевченко, 2
Albina P. Bondarenko, MD, PhD (Med.), Leading Staff Scientist, Head of Laboratory of Bacterial Infections
2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610
Юлия Александровна Натыкан, заведующая отделом обеспечения эпидемиологического надзора, Федеральное бюджетное учреждение здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Амурской области»
680610, г. Хабаровск, ул. Шевченко, 2,
675002, г. Благовещенск, ул. Первомайская, 30
Yulia A. Natykan, Head of the Epidemiological Surveillance Department, Center of Hygiene and Epidemiology in the Amur Region
2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610,
30 Pervomayskaya Str., Blagoveshchensk, 675002
Ольга Евгеньевна Троценко, доктор медицинских наук, директор
680610, г. Хабаровск, ул. Шевченко, 2
Olga E. Trotsenko, MD, PhD, DSc (Med.), Director
2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610
Ольга Петровна Курганова, кандидат медицинских наук, руководитель
675002, г. Благовещенск, ул. Первомайская, 30
Olga P. Kurganova, MD, PhD (Med.), Head
30 Pervomayskaya Str., Blagoveshchensk, 675002
Наталья Юрьевна Пшеничная, доктор медицинских наук, профессор, заместитель директора по клинико-аналитической работе
111123, г. Москва, ул. Новогиреевская, 3a
Natalya Yu. Pshenichnaya, MD, PhD, DSc (Med.), Professor, Deputy Director of Clinical and Analytical Work
3a Novogireevskaya Str., Moscow, 111123
Екатерина Константиновна Таран, заведующая бактериологической лабораторией
680009, г. Хабаровск, ул. Краснодарская, 9
Ekaterina K. Taran, Head of Bacteriological Laboratory
9 Krasnodarskaya Str., Khabarovsk, 680009
Введение. Бактерии Chryseobacterium indologenes являются редко выявляемыми, малоизученными условно-патогенными бактериями из группы неферментирующих грамотрицательных бактерий (НГОБ), характеризующимися высокой природной и приобретенной множественной лекарственной устойчивостью и причастностью к инфекциям, связанным с оказанием медицинской помощи.
Цель. Анализ выявляемости штаммов C. indologenes из различного биоматериала при пневмонии, а также уровня резистентности возбудителя к антимикробным препаратам (АМП).
Материалы и методы. Материалом для исследования послужили 1740 клинических проб, полученных от больных пневмонией, госпитализированных в стационары г. Хабаровска в период пандемии COVID-19. В том числе: 1305 проб ‒ респираторные образцы (744 пробы мокроты и 561 назофарингеальный мазок), а также 435 проб аутопсийного материала (ткань лёгкого) от лиц с летальным исходом болезни. Исследование выполнялось классическим бактериологическим методом. Идентификацию возбудителей проводили в баканализаторе Vitek 2 и масс-спектрометре Vitek MS. Чувствительность к АМП определяли диско-диффузионным методом и в баканализаторе.
Результаты. Проведен сравнительный анализ выявляемости возбудителей всей группы НГОБ и C. indologenes из различных клинических образцов. Суммарный показатель выявляемости НГОБ составил 17,3%. Наиболее часто НГОБ выделяли из аутопсийного материала – в 31,7% случаев, реже – из мокроты и назофарингеальных мазков (13,8 и 10,7%, соответственно). Суммарный показатель выделения C. indologenes составил 0,5% случаев (8 изолятов из 1740 проб). С наибольшей частотой этот возбудитель выделяли из фарингеальных мазков – 1,1% (6 случаев из 561 пробы), с наименьшей – из мокроты, что составило 0,3% (2 изолята из 744 проб). В целом из респираторных образцов возбудитель выявляли в 0,6% случаев (8 изолятов из 1305 проб). В аутопсийном материале данный патоген не был обнаружен. Уровень выделения карбапенемустойчивых вариантов C. indologenes составил 75% (6 случаев из 8).
Заключение. Дальнейшая интенсификация методов диагностики позволит чаще выявлять данные необычные патогены, клиническое значение которых нуждается в дополнительном обосновании.
Introduction. Chryseobacterium indologenes bacteria are rarely detected, poorly studied opportunistic bacteria of the nonfermenting gram-negative bacilli group that are characterized by high intrinsic and acquired multidrug resistance and involvement in healthcare associated infections.
Aim. To analyze detection rate of C. indologenes strains from various biomaterials obtained from patients with pneumonia, as well as levels of pathogen drug resistance to antimicrobial drugs.
Materials and methods. The research included 1740 clinical samples obtained from patients with pneumonia hospitalized in in-patient facilities of the Khabarovsk city during the COVID-19 pandemic. Clinical samples included 1305 respiratory samples (744 sputum samples and 561 nasopharyngeal swabs), 435 samples of autopsy material (lung tissue) obtained from patients with a fatal outcome of the disease. The study was performed via classical bacteriological method. Pathogens were identified with Vitek 2 bacteriological analyzer and Vitek MS mass spectrometer. Sensitivity to antimicrobial drugs was determined by disk-diffusion method and in a bacteriological analyzer.
Results. A comparative analysis of detection of the entire nonfermenting gram-negative bacteria (NFGNB) group and C. indologenes from various clinical samples was carried out. Detection rate of NFGNB equaled 17.3%. NFGNB were isolated from autopsy material most often ‒ in 31.7% of cases, less often ‒ from sputum and nasopharyngeal smears (13.8% and 10.7%, respectively). C. indologenes was detected in 0.5% of the cases (8 isolates out of 1740 samples). Isolation of this pathogen was most frequent in nasopharyngeal smears – in 1.1% (6 cases out of 561 samples), least frequent ‒ from sputum, which totaled 0.3% (2 isolates from 744 samples). The detection rate of the pathogen in respiratory samples equaled 0.6% (8 isolates out of 1305 samples). This pathogen was not found in the autopsy material. Carbapenem-resistant variants of C. indologenes were isolated in 75% (6 cases out of 8) of the cases.
Conclusion. Further intensifying of diagnostic methods will result in more frequent detection of these unusual pathogens, clinical significance of which needs more justification.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.