<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">cfpd</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Бюллетень физиологии и патологии дыхания</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Bulletin Physiology and Pathology of Respiration</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">1998-5029</issn><publisher><publisher-name>Дальневосточный научный центр физиологии и патологии дыхания</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">cfpd-600</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>ИЗУЧЕНИЕ МИКРОБНОГО СООБЩЕСТВА ГОРОДСКИХ ПОЧВ МЕТОДОМ ГАЗОВОЙ ХРОМАТОГРАФИИ – МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>THE STUDY OF MICROBIAL ASSOCIATION IN CITY SOILS BY THE GAS CHROMATOGRAPHY-MASS SPECTROMETRY METHOD</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шумилова</surname><given-names>Людмила Павловна</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Shumilova</surname><given-names>Lyudmila P.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">Shumilova.85@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Куимова</surname><given-names>Наталья Григорьевна</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Kuimova</surname><given-names>Natalʹya G.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">noemail@neicon.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru">Институт геологии и природопользования Дальневосточного отделения РАН<country>Россия</country></aff><aff xml:lang="en">Institute of Geology and Nature Management of Far Eastern Branch RAS<country>Russian Federation</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2013</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>19</day><month>02</month><year>2020</year></pub-date><volume>0</volume><issue>50</issue><fpage>121</fpage><lpage>125</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Шумилова Л.П., Куимова Н.Г., 2020</copyright-statement><copyright-year>2020</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Шумилова Л.П., Куимова Н.Г.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Shumilova L.P., Kuimova N.G.</copyright-holder><license license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://cfpd.elpub.ru/jour/article/view/600">https://cfpd.elpub.ru/jour/article/view/600</self-uri><abstract><p>Индикатором благополучия почв может служить состояние почвенных микробных сообществ. Традиционные микробиологические методы, связанные с использованием селективных сред, требуют много времени для выделения и идентификации микроорганизмов. Одним из современных методов, используемых для изучения разнообразия микробных сообществ, является метод газовой хроматографии – масс-спектрометрии. Данный метод позволяет реконструировать состав и структуру сообщества микроорганизмов по содержанию маркеров (жирных кислот, альдегидов, спиртов и стеринов) в природных образцах. Использование метода газовой хроматографии – масс-спектрометрии позволяет сократить время и стоимость исследования, благодаря отсутствию стадий повторных пересевов и тестовых ферментаций, которые особенно сложны, трудоемки и длительны. Целью выполненных исследований явилось изучение общей численности и видового разнообразия микробного сообщества почв г. Благовещенска (Амурская область) методом газовой хроматографии – масс-спектрометрии. Из почвенных образцов экстрагировали липидные компоненты методом кислого метанолиза в 0,4 мл 1М HCl в метаноле в течение одного часа при температуре 80ºС. Жирнокислотный состав определяли на газовом хроматографе HP-5973 Agilent Technologies. В результате исследований выделено 44 вида бактерий, принадлежащих к 32 родам. Составлен общий список видов. Санитарно-опасных видов бактерий в городских почвах не обнаружено. Определена общая численность микроорганизмов в почвах различных функциональных зон г. Благовещенска. Максимальная численность микроорганизмов выявлена в почвах селитебно-транспортной зоны (48,1×106 КОЕ/г) со средним уровнем загрязнения (Zc 16-32) тяжелыми металлами, что обусловлено влиянием бытовой и хозяйственной деятельности человека. В почвах промышленной зоны с высоким, опасным уровнем загрязнения (Zc&gt;32) наблюдали сокращение количества микроорганизмов (13,1×106 КОЕ/г) относительно фона (29,8×106 КОЕ/г).</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Microbial associations can serve as the indicator of soils wellbeing. Traditional microbiological methods connected with the use of selective nutrient environments take up a lot of time for isolation and identification of microorganisms. The gas chromatography-mass spectrometry method is one of the modern methods used for studying of microbial variety. This method allows to reconstruct the composition and structure of microbial association according to markers (fatty acids, aldehydes, alcohols and sterols) in natural samples. The gas chromatography-mass spectrometry method allows to reduce time and research cost for lack of stages of repeated passages and test fermentations which are especially difficult, labor-consuming and long. The studying of total number and a specific variety of soil’s microbial association of Blagoveshchensk (Amur region) by the method of gas chromatography - mass spectrometry was the purpose of the executed researches. Lipid components were extracted from soil samples by the method of acid methanolysis in 0.4 ml 1M of HCl in methanol within one hour at 80ºC. The composition of fatty acids was defined with the gas chromatograph HP-5973 Agilent Technologies. As a result of the research 44 species of the bacteria belonging to 32 genera were isolated. The general list of bacteria species was made. Sanitary-dangerous species of bacteria weren't revealed in city soils. Total number of microorganisms in the soils of various functional zones of Blagoveshchensk was found. The increase in the number of microorganisms was revealed in the soils of a building-transport zone (48.1×106 CFU/g) with the average level of heavy metals pollution (Zc 16-32), which is conditioned by communal and economic activities of a man. The decrease in the number of microorganisms (13.1×106 CFU/g) was identified in the soils of an industrial zone with high, dangerous level of pollution (Zc&gt;32) in comparison with the background (29.8×106 CFU/g).</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>городские почвы</kwd><kwd>микробное сообщество</kwd><kwd>газовая хроматография – масс-спектрометрия</kwd><kwd>загрязнение</kwd><kwd>тяжелые металлы</kwd><kwd>city soils</kwd><kwd>microbial community</kwd><kwd>gas chromatography-mass spectrometry</kwd><kwd>fatty acids</kwd><kwd>pollution</kwd><kwd>heavy metals</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Артамонова В.С. Микробиологические особенности антропогенно преобразованных почв Западной Сибири. Новосибирск: СО РАН, 2002. 225 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Артамонова В.С. Микробиологические особенности антропогенно преобразованных почв Западной Сибири. Новосибирск: СО РАН, 2002. 225 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Верховцева Н.В., Осипов Г.А. Метод газовой хроматографии-масс-спектрометрии в изучении микробных сообществ почв агроценоза // Пробл. агрохим. и экол. 2008. №1. С.51–54.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Верховцева Н.В., Осипов Г.А. Метод газовой хроматографии-масс-спектрометрии в изучении микробных сообществ почв агроценоза // Пробл. агрохим. и экол. 2008. №1. С.51–54.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Егорова Л.Н. Почвенные грибы Дальнего Востока: гифомицеты. Л.: Наука, 1986. 192 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Егорова Л.Н. Почвенные грибы Дальнего Востока: гифомицеты. Л.: Наука, 1986. 192 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Егорова Л.Н., Ковалева Г.В. Структура сообществ микромицетов в естественных и антропогенно нарушенных бурых лесных почвах полуострова Муравьева-Амурского (Южное Приморье) // Микология и фитопатология. 2011. Т.45, вып.2. С.125–133.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Егорова Л.Н., Ковалева Г.В. Структура сообществ микромицетов в естественных и антропогенно нарушенных бурых лесных почвах полуострова Муравьева-Амурского (Южное Приморье) // Микология и фитопатология. 2011. Т.45, вып.2. С.125–133.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Котельникова И.М., Сергеева А.Г., Куимова Н.Г. Полициклические ароматические углеводороды в снежном покрове и почвах г. Благовещенска // Экол. и промышл. России. 2013. №4. С.44–50.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Котельникова И.М., Сергеева А.Г., Куимова Н.Г. Полициклические ароматические углеводороды в снежном покрове и почвах г. Благовещенска // Экол. и промышл. России. 2013. №4. С.44–50.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Куимова Н.Г., Шумилова Л.П., Павлова Л.М. Фитотоксичность почв и микроскопических грибов как показатель загрязнения экосистем тяжелыми металлами // Вестн. Северо-Вост. науч. центра ДВО РАН. 2012. №1. С.102–107.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Куимова Н.Г., Шумилова Л.П., Павлова Л.М. Фитотоксичность почв и микроскопических грибов как показатель загрязнения экосистем тяжелыми металлами // Вестн. Северо-Вост. науч. центра ДВО РАН. 2012. №1. С.102–107.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit7"><label>7</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Эколого-геохимическая оценка аэротехногенного загрязнения урбанизированной территории по состоянию снежного покрова / Н.Г.Куимова [и др.] // Геоэкология. 2012. №5. С.422–435.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Эколого-геохимическая оценка аэротехногенного загрязнения урбанизированной территории по состоянию снежного покрова / Н.Г.Куимова [и др.] // Геоэкология. 2012. №5. С.422–435.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit8"><label>8</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Лысак Л.В. Бактериальные сообщества городских почв: автореф. дис. … д-ра биол. наук. М., 2010. 46 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Лысак Л.В. Бактериальные сообщества городских почв: автореф. дис. … д-ра биол. наук. М., 2010. 46 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit9"><label>9</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Пат. 2086642 RU. Способ определения родового (видового) состава ассоциации микроорганизмов / Г.А.Осипов; опубл. 10.08.1997.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Пат. 2086642 RU. Способ определения родового (видового) состава ассоциации микроорганизмов / Г.А.Осипов; опубл. 10.08.1997.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit10"><label>10</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Почва, город, экология / под ред. Г.В.Добровольского. М.: Фонд «За экологическую грамотность», 1997. 320 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Почва, город, экология / под ред. Г.В.Добровольского. М.: Фонд «За экологическую грамотность», 1997. 320 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit11"><label>11</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Современная микробиология. Прокариоты: в 2-х т. / под ред. Й.Ленгелера, Г.Древса, Г.Шлегеля. М.: Мир, 2005. Т.1,2. 1152 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Современная микробиология. Прокариоты: в 2-х т. / под ред. Й.Ленгелера, Г.Древса, Г.Шлегеля. М.: Мир, 2005. Т.1,2. 1152 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit12"><label>12</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Шумилова Л.П. Оценка экологического состояния почв и воздушной среды г. Благовещенска: автореф. дис. … канд. биол. наук. Владивосток, 2012. 20 с.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Шумилова Л.П. Оценка экологического состояния почв и воздушной среды г. Благовещенска: автореф. дис. … канд. биол. наук. Владивосток, 2012. 20 с.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit13"><label>13</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Benz M., Schink B., Brune A. Humic acid reduction by Propionibacterium freudenreichii and other fermenting bacteria // Appl. Environ. Microbiol. 1998. Vol.64, №11. Р.4507–4512.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Benz M., Schink B., Brune A. Humic acid reduction by Propionibacterium freudenreichii and other fermenting bacteria // Appl. Environ. Microbiol. 1998. Vol.64, №11. Р.4507–4512.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
