cfpdБюллетень физиологии и патологии дыханияBulletin Physiology and Pathology of Respiration1998-5029Дальневосточный научный центр физиологии и патологии дыхания10.36604/1998-5029-2021-81-19-26cfpd-954Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯORIGINAL RESEARCHСравнительная характеристика основных маркеров SARS-CoV-2 среди условно-здорового населения г. Хабаровска в периоды спада интенсивности эпидемического процесса COVID-19Dynamics of morbidity of the population with respiratory diseases in the pandemic COVID-19 period in the Far Eastern Federal Districthttps://orcid.org/0000-0002-5695-6752БазыкинаЕ. А.BazykinaE. A.

Елена Анатольевна Базыкина - младший научный сотрудник, лаборатория эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИД.

680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2

Elena A. Bazykina - Junior Staff Scientist, Laboratory of Epidemiology and Prevention of Viral Hepatitis and AIDS.

2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610

alyonaf@yandex.ruТроценкоО. Е.TrotsenkoO. E.

Ольга Евгеньевна Троценко - доктор медицинских наук, директор.

680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2

Olga E. Trotsenko - MD, PhD, DSc (Med.), Director.

2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610

trotsenko_oe@hniiem.ruБалахонцеваЛ. А.BalakhontsevaL. A.

Людмила Анатольевна Балахонцева - руководитель Дальневосточного окружного центра по профилактике и борьбе со СПИД.

680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2

Ludmila A. Balakhontseva - Head of the Far Eastern Regional Center for Prevention and Combat Against AIDS.

2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610

dvaids@mail.ruКотоваВ. О.KotovaV. O.

Валерия Олеговна Котова - зав. лабораторией эпидемиологии и профилактики вирусных гепатитов и СПИДа.

680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2

Valeria О. Kotova - Head of Laboratory of Epidemiology and Prevention of Viral Hepatitis and AIDS.

2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610

dvaids@mail.ruКоритаТ. В.KoritaT. V.

Татьяна Васильевна Корита - кандидат медицинских наук, ученый секретарь.

680610, Хабаровск, ул. Шевченко, 2

Tatyana V. Korita - MD, PhD (Med.), Scientific Secretary.

2 Shevchenko Str., Khabarovsk, 680610

adm@hniiem.ruФедеральное бюджетное учреждение науки Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человекаРоссияKhabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of Federal Service for Surveillance on Consumer Rights Protection and Human WellbeingRussian Federation2021290920210811926Copyright © Базыкина Е.А., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А., Котова В.О., Корита Т.В., 20212021Базыкина Е.А., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А., Котова В.О., Корита Т.В.Bazykina E.A., Trotsenko O.E., Balakhontseva L.A., Kotova V.O., Korita T.V.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://cfpd.elpub.ru/jour/article/view/954Введение

Введение. Пандемия COVID-19 привела к необходимости введения беспрецедентных противоэпидемических мер для снижения скорости распространения заболевания, как в мире, так и в Российской Федерации. Крайне важным является мониторинг заболеваемости, а также серопревалентности к возбудителю данного опасного заболевания.

Цель

Цель. Оценка выявляемости РНК SARS-CoV-2 и уровней серопревалентности среди условноздорового населения г. Хабаровска в разные этапы пандемии. Материалы и методы. Наличие РНК вируса определяли методом ПЦР в носоглоточных мазках, антител класса G к спайковому (S) протеину SARS-CoV-2 – в сыворотке крови методом ИФА. Для анализа выбраны месяцы, характеризовавшиеся снижением заболеваемости COVID-19: первый период – с сентября по середину октября 2020 г., второй период – с февраля по середину марта 2021 г.

Результаты

Результаты. Выявлено двукратное снижение количества РНК-позитивных проб с 11,4 до 5,8% в зимне-весенний период 2021 г. по сравнению с осенью 2020 г., что наиболее вероятно связано со значительным увеличением количества лиц, имевших антитела к SARS-CoV-2. Их число увеличилось с 38,6 до 54,5% за анализируемый период времени. Заключение. Для предотвращения усугубления эпидемической ситуации относительно COVID-19 в регионе необходимо строгое соблюдение противоэпидемических мер для предотвращения завоза и распространения инфекции, а также более активное вовлечение населения в программу вакцинации.

Introduction

Introduction. Currently, COVID-19, which is rapidly spreading around the world in the form of a pandemic, is a serious public health problem that poses a significant epidemiological and medico-social threat to the population and its quality of life, and affects all spheres of public life and economy. Aim. To assess the degree of influence of the pandemic of the new respiratory viral infection COVID-19 on the level of registered primary morbidity by classes of diseases, including the class "Diseases of the respiratory system" in the territory of the Far Eastern Federal District.

Materials and methods

Materials and methods. To implement the tasks of the study, a complex of analytical, epidemiological and statistical studies was carried out. Methods used: epidemiological analysis and monitoring, statistical, comparative and correlation analysis and methods for analyzing time series. Epidemiological and statistical assessment of the incidence of the population was carried out on the basis of ICD-10 according to the data of the state statistical monitoring of the incidence of the population of the Russian Federation for 2019-2020 using the database of the Ministry of Health of the Russian Federation, the Central Research Institute of Organization and Informatization of Healthcare of the Ministry of Health of the Russian Federation.

Results

Results. The pandemic of the new respiratory viral infection COVID-19 significantly changed the dynamics of the registered morbidity in the adult population, which dropped sharply in all ICD-10 classes, most intensively in the classes "Diseases of the endocrine system" (by 27.8%), "Diseases of the blood and hematopoietic organs" (by 22.6%), "Neoplasms" (by 21.1%), "Diseases of the circulatory system" (by 18.5%), with the exception of the class "Diseases of the respiratory system", the level of primary morbidity for which in the territory of the Far Eastern Federal District in 2020 increased by 23.9%. The most common and severe clinical manifestation of COVID-19 is bilateral pneumonia, the incidence of which among the adult population in the Far Eastern Federal District increased 2.7 times, and in the territory of the Russian Federation – 3.8 times. At the same time, the incidence of pneumonia in the child population decreased by 36.4%. Along with the growth of acute forms of respiratory pathology during the COVID-19 pandemic in the Far Eastern Federal District, the level of registered primary morbidity of chronic respiratory diseases decreased: chronic bronchitis (by 22.3%), bronchial

asthma (by 20

asthma (by 20.8%), COPD (by 3, 6%).

Conclusion

Conclusion. The negative dynamics of the growth of the registered morbidity of the population can have negative consequences due to the late detection and untimely diagnosis of chronic forms of pathology, including respiratory diseases, their progression and the development of life-threatening complications of the disease and, as a consequence, an increase in mortality from these causes of the population, who did not receive timely and adequate medical assistance.

COVID-19ПЦРИФАсеропревалентностьскрининговое обследованиеCOVID-19 pandemicmorbidity of the populationepidemiological monitoring of diseasesrespiratory diseasesRussian FederationFar Eastern Federal DistrictReferencesБрико Н.И. 100 лет пандемии: уроки истории. Новый этап вакцинопрофилактики // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2018. Т.4, №17. С.68‒75.Briko N.I. 100 Years after the Spanish Flu Pandemic. The Evolution of the Influenza Virus and the Development of the Flu Vaccine. Epidemiology and Vaccinal Prevention 2018; 17(4):68‒75 (in Russian).Шуряева А.К., Малова Т.В., Давыдова Е.Е., Савочкина Ю.А., Богословская Е.В., Минтаев Р.Р., Цыганова Г.М., Шивлягина Е.Е., Ибрагимова А.Ш., Носова А.О., Шипулин Г.А., Юдин С.М. Разработка тест-системы для диагностики COVID-19 в формате ОТ-ПЦР в режиме реального времени // Медицина экстремальных ситуаций. 2020. №3. С.48–54. https://doi.org/10.47183/mes.2020.011Shuryaeva A.K., Malova T.V., Davydova E.E., Savochkina Yu.A., Bogoslovskaya E.V., Mintaev R.R., Tsyganova G.M., Shivlyagina E.E., Ibragimova A.Sh., Shipulin G.A., Yudin S.M. Development of the COVID-19 Real-Time RTPCR Testing System. Extreme Medicine 2020; (3):43–8 (in Russian). https://doi.org/10.47183/mes.2020.011Смирнов А.Е., Смирнова Н.Г. Пандемия COVID-19: вызовы для медицины и общества // Материалы международной научно-практической конференции «Пространства социальной напряженности, глобальные и региональные вызовы и факторы устойчивого развития в современную эпоху: стратегические консенсусные взаимодействия и новые прорывы». Иркутск, 2020. С.299–301.Smirnov A.E., Smirnova N.G. COVID-19 pandemic: challenges for healthcare system and society. In: Proceedings of the International practice-to-science conference “Spaces of social tension, global and regional challenges and factors of stable development in current time: strategic and consensus interactions and new breakthroughs”. Irkutsk; 2020: 229-301 (in Russian).Попова А.Ю., Андреева Е.Е., Бабура Е.А., Балахонов С.В., Башкетова Н.С., Буланов М.В., Валеуллина Н.Н., Горяев Д.В., Детковская Н.Н., Ежлова Е.Б., Зайцева Н.Н., Историк О.А., Ковальчук И.В., Козловских Д.Н., Комбарова С.В., Курганова О.П., Кутырев В.В., Ломовцев А.Э., Лукичева Л.А., Лялина Л.В., Мельникова А.А., Микаилова О.М., Носков А.К., Носкова Л.Н., Оглезнева Е.Е., Осмоловская Т.П., Патяшина М.А., Пеньковская Н.А., Самойлова Л.В., Смирнов В.С., Степанова Т.Ф., Троценко О.Е., Тотолян А.А. Особенности формирования серопревалентности населения Российской Федерации к нуклеокапсиду SARS-CoV-2 в первую волну эпидемии COVID-19 // Инфекция и иммунитет. 2021. Т.11, №2. С.297–323. https://doi.org/10.15789/2220-7619-FOD-1684Popova A.Yu., Andreeva E.E., Babura E.A., Balakhonov S.V., Bashketova N.S., Bulanov M.V., Valeullina N.N., Goryaev D.V., Detkovskaya N.N., Ezhlova E.B., Zaitseva N.N., Istorik O.A., Kovalchuk I.V., Kozlovskikh D.N., Kombarova S.V., Kurganova O.P., Kutyrev V.V., Lomovtsev A.E., Lukicheva L.A., Lyalina L.V., Melnikova A.A., Mikailova O.M., Noskov A.K., Noskova L.N., Oglezneva E.E., Osmolovskay T.P., Patyashina M.A., Penkovskaya N.A., Samoilova L.V., Smirnov V.S., Stepanova T.F., Trotsenko O.E., Totolyan A.A. Features of developing SARS-CoV-2 nucleocapsid protein population-based seroprevalence during the first wave of the COVID-19 epidemic in the Russian Federation. Russian Journal of Infection and Immunity 2021; 11(2):297–323 (in Russian). https://doi.org/10.15789/2220-7619-FOD-1684COVID-19 coronavirus pandemic. Reported Cases and Deaths by Country or Territory // Worldometer. URL: https://www.worldometers.info/coronavirus/COVID-19 coronavirus pandemic. Reported Cases and Deaths by Country or Territory. Worldometer. Available at: https://www.worldometers.info/coronavirus/Отчёт о текущей ситуации по борьбе с коронавирусом. 1 апреля 2021. Коронавирус COVID–19: официальная информация о коронавирусе в России. URL: https://стопкоронавирус.рф/ai/doc/829/attach/2021-04-01_coronavirus_government_report.pdfReport on current situation concerning combat against coronavirus. April 1, 2021. Coronavirus COVID–19: Official information on coronavirus in Russia. Available at: https://стопкоронавирус.рф/ai/doc/829/attach/2021-04-01_coronavirus_government_report.pdf (in Russian).Wei L., Lin J., Duan X., Huang W., Lu X., Zhou J., Zong Zh. Asymptomatic COVID-19 Patients Can Contaminate Their Surroundings: an Environment Sampling Study // mSphere. 2020. Vol.5, №3. Article number: e00442-20. https://doi.org/10.1128/mSphere.00442-20Wei L., Lin J., Duan X., Huang W., Lu X., Zhou J., Zong Zh. Asymptomatic COVID-19 Patients Can Contaminate Their Surroundings: an Environment Sampling Study. mSphere 2020; 5(3):e00442-20. https://doi.org/10.1128/mSphere.00442-20Bai Y., Yao L., Wei T., Tian F., Jin D.Y., Chen L., Wang M. Presumed Asymptomatic Carrier Transmission of COVID-19 // JAMA. 2020. Vol.323, №14. P.1406–1407. https://doi.org/10.1001/jama.2020.2565Bai Y., Yao L., Wei T., Tian F., Jin D.Y., Chen L., Wang M. Presumed Asymptomatic Carrier Transmission of COVID-19. JAMA 2020; 323(14):1406–1407. https://doi.org/10.1001/jama.2020.2565Huang L., Zhang X., Zhang X., Wei Z., Zhang L., Xu J., Liang P., Xu Y., Zhang C., Xu A. Rapid asymptomatic transmission of COVID-19 during the incubation period demonstrating strong infectivity in a cluster of youngsters aged 16-23 years outside Wuhan and characteristics of young patients with COVID-19: A prospective contact-tracing study // J. Infect. 2020. Vol.80, №6. Р.e1–e13. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2020.03.006Huang L., Zhang X., Zhang X., Wei Z., Zhang L., Xu J., Liang P., Xu Y., Zhang C., Xu A. Rapid asymptomatic transmission of COVID-19 during the incubation period demonstrating strong infectivity in a cluster of youngsters aged 16-23 years outside Wuhan and characteristics of young patients with COVID-19: A prospective contact-tracing study. J. Infect. 2020; 80(6):e1–e13. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2020.03.006Ye F., Xu S., Rong Z., Xu R., Liu X., Deng P., Liu H., Xu X. Delivery of infection from asymptomatic carriers of COVID-19 in a familial cluster // Int. J. Infect. Dis. 2020. Vol.94. P.133–138. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.03.042Ye F., Xu S., Rong Z., Xu R., Liu X., Deng P., Liu H., Xu X. Delivery of infection from asymptomatic carriers of COVID-19 in a familial cluster. Int. J. Infect. Dis. 2020; 94:133–138. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.03.042Rocklöv J., Sjödin H., Wilder-Smith A. COVID-19 outbreak on the Diamond Princess cruise ship: estimating the epidemic potential and effectiveness of public health countermeasures // J. Travel Med. 2020. Vol.27, №3. Article number: taaa030. https://doi.org/10.1093/jtm/taaa030Rocklöv J., Sjödin H., Wilder-Smith A. COVID-19 outbreak on the Diamond Princess cruise ship: estimating the epidemic potential and effectiveness of public health countermeasures. J. Travel Med. 2020; 27(3):taaa03. https://doi.org/10.1093/jtm/taaa030.Endo A., Abbott S., Kucharski A.J., Funk S. Estimating the overdispersion in COVID-19 transmission using outbreak sizes outside China // Wellcome Open Res. 2020. Vol.5. Article number: 67. https://doi.org/10.12688/wellcomeopenres.15842.3Endo A., Abbott S., Kucharski A.J., Funk S. Estimating the overdispersion in COVID-19 transmission using outbreak sizes outside China. Wellcome Open Res. 2020; 5:67. https://doi.org/10.12688/wellcomeopenres.15842.3Гланц С. Медико-биологическая статистика: пер. с англ. М.: Практика, 1999. 459 с. ISBN 5-89816-009-4Glantz S.A. Primer of Biostatistics. Moscow: Praktika; 1999 (in Russian). ISBN 5-89816-009-4.Гржибовский А.М. Анализ номинальных данных (независимые наблюдения) // Экология человека, 2008. №6. С.58–8.Grjibovski A.M. Analysis on nominal data (independent observations). Human Ecology 2008; (6):58–68 (in Russian).Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Мельникова А.А., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Лялина Л.В., Гарбуз Ю.А., Смирнов В.С., Ломоносова В.И., Балахонцева Л.А., Котова В.О., Базыкина Е.А., Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Алейникова Н.В., Бебенина Л.А., Лосева С.М., Каравянская Т.Н., Тотолян А.А. Уровень серопревалентности к SARS-CoV-2 среди жителей Хабаровского края на фоне эпидемии COVID-19 // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021. Т.98, №1. С.7–17. https://doi.org/10.36233/0372-9311-92Popova A.Yu., Ezhlova E.B., Melnikova A.A., Trotsenko O.E., Zaitseva T.A., Lyalina L.V., Garbuz Yu.A., Smirnov V.S., Lomonosova V.I., Balakhontseva L.A., Kotova V.O., Bazykina E.A., Butakova L.V., Sapega E.Yu., Aleinikova N.V., Bebenina L.A., Loseva S.M., Karavyanskaya T.N., Totolyan A.A. The seroprevalence of SARS-CoV-2 among residents of the Khabarovsk Krai during the COVID-19 epidemic. Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology = Zhurnal mikrobiologii, èpidemiologii i immunobiologii 2021; 98(1):7–17 (in Russian). https://doi.org/10.36233/0372-9311-92Zost S.J., Gilchuk P., Case J.B., Binshtein E., Chen R.E., Nkolola J.P., Schäfer A., Reidy J.X., Trivette A., Nargi R.S., et al. Potently neutralizing and protective human antibodies against SARS-CoV-2 // Nature. 2020. Vol.584, №7821. P.443–449. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2548-6Zost S.J., Gilchuk P., Case J.B., Binshtein E., Chen R.E., Nkolola J.P., Schäfer A., Reidy J.X., Trivette A., Nargi R.S., Sutton R.E., Suryadevara N., Martinez D.R., Williamson L.E., Chen E.C., Jones T., Day S., Myers L., Hassan A.O., Kafai N.M., Winkler E.S., Fox J.M., Shrihari S., Mueller B.K., Meiler J., Chandrashekar A., Mercado N.B., Steinhardt J.J., Ren K., Loo Y.M., Kallewaard N.L., McCune B.T., Keeler S.P., Holtzman M.J., Barouch D.H., Gralinski L.E., Baric R.S., Thackray L.B., Diamond M.S., Carnahan R.H., Crowe J.E. Jr. Potently neutralizing and protective human antibodies against SARS-CoV-2. Nature 2020; 584(7821):443–449. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2548-6Yang J., Wang W., Chen Z., Lu S., Yang F., Bi Z., Bao L., Mo F., Li X., Huang Y., et al. A vaccine targeting the RBD of the S protein of SARS-CoV-2 induces protective immunity // Nature. 2020. Vol.586, №7830. P.572–577. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2599-8Yang J., Wang W., Chen Z., Lu S., Yang F., Bi Z., Bao L., Mo F., Li X., Huang Y., Hong W., Yang Y., Zhao Y., Ye F., Lin S., Deng W., Chen H., Lei H., Zhang Z., Luo M., Gao H., Zheng Y., Gong Y., Jiang X., Xu Y., Lv Q., Li D., Wang M., Li F., Wang S., Wang G., Yu P., Qu Y., Yang L., Deng H., Tong A., Li J., Wang Z., Yang J., Shen G., Zhao Z., Li Y., Luo J., Liu H., Yu W., Yang M., Xu J., Wang J., Li H., Wang H., Kuang D., Lin P., Hu Z., Guo W., Cheng W., He Y., Song X., Chen C., Xue Z., Yao S., Chen L., Ma X., Chen S., Gou M., Huang W., Wang Y., Fan C., Tian Z., Shi M., Wang F.S., Dai L., Wu M., Li G., Wang G., Peng Y., Qian Z., Huang C., Lau J.Y., Yang Z., Wei Y., Cen X., Peng X., Qin C., Zhang K., Lu G., Wei X. A vaccine targeting the RBD of the S protein of SARS-CoV-2 induces protective immunity. Nature 2020; 586(7830):572–577. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2599-8

The authors declare that there are no conflicts of interest present.