Разработка метода диагностики редковыявляемых бактерий Achromobacter xylosoxidans

   Введение. В последнее десятилетие Achromobacter xylosoxidans проявил себя как значимый патоген, требующий совершенствования методов бактериологической диагностики.

   Цель. Разработка доступного для бактериологической практики метода идентификации A. xylosoxidans.

   Материалы и методы. Сформированы две группы культур: опытные – 4 штамма A. xylosoxidans и группа сравнения – 33 штамма, относящихся к 10 другим видам неферментирующих грамотрицательных бактерий (НГОБ), имеющим сходные фенотипические признаки (Stenotrophomonas maltophilia, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas putida, Pseudomonas stutzeri, Pseudomonas fluorescens, Chryseobacterium indologenes, Empedobacter brevis, Elizabethkingia meningoseptica, Burkholderia cepacia). Принадлежность штаммов к указанным видам бактерий подтверждена двумя методами – с помощью баканализатора Vitek 2 Compact 30 и масс-спектрометра Vitek MS. При культивировании посевов использован СО₂-инкубатор.

   Результаты. Разработанный способ идентификации A. xylosoxidans основан на феномене «слизистого» роста чистых культур на кровяном агаре при инкубации в атмосфере СО₂ в течение 24–48 часов. Экспериментально обоснована высокая диагностическая значимость данного признака для дифференциации возбудителя от сходных микроорганизмов. В ходе испытаний искомый фенотипический маркер проявился у всех 4 штаммов опытной группы (A. xylosoxidans) и полностью отсутствовал у 33 изолятов 10 других видов НГОБ.

   Заключение. Предложенный методический прием позволит оптимизировать бактериологическую диагностику этого трудно идентифицируемого и потому редковыявляемого патогена при широком спектре вызываемых им заболеваний, снизив частоту диагностических ошибок.

1. Bayless D.R., Dumais M.G., McHugh J.W., Ranganath N., Fida M., Chesdachai S., Abu Saleh O.M. Clinical and microbiologic features of Achromobacter species: a 10-year, multicenter experience // J. Clin. Microbiol. 2025. Vol. 63, № 10. Article number: e0072425. doi: 10.1128/jcm.00724-25

2. Махмутова В.Р., Гембицкая Т.Е., Черменский А.Г., Титова О.Н., Кузубова Н.А. Мониторинг инфицирования и резистентности Achromobacter xylosoxidans у взрослых пациентов с муковисцидозом // РМЖ. Медицинское обозрение. 2021. T. 5, № 7. С.462–467. doi: 10.32364/2587-6821-2021-5-7-462-467

3. Isler B., Kidd T.J., Stewart A.G., Harris P., Paterson D.L. Achromobacter infections and treatment options // Antimicrob. Agents Chemother. 2020. Vol. 64, № 11. Article number: e01025-20. doi: 10.1128/AAC.01025-20

4. Чеботарь И.В., Бочарова Ю.А. Загадочный Achromobacter // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022. T. 24, № 1. С. 4–13. doi: 10.36488/cmac.2022.1.4-13

5. Swenson C.E., Sadikot R.T. Achromobacter respiratory infections // Ann. Am. Thorac. Soc. 2015. Vol. 12, № 2. P. 252–258. doi: 10.1513/AnnalsATS.201406-288FR

6. Marion-Sanchez K., Lion F., Olive C., Cailleaux G., Roques F. Mediastinitis superinfected by Achromobacter xylosoxidans. A case report // J. Infect. Chemother. 2018. Vol.24. P.987–989. doi: 10.1016/j.jiac.2018.05.005

7. Asano K., Tada S., Matsumoto T., Miyase S., Kamio T., Sakurai K., Iida M. A novel bacterium Achromobacter xylosoxidans as a cause of liver abscess: three case reports // J. Hepatol. 2005. Vol. 43, № 2. P. 362–365. doi: 10.1016/j.jhep.2005.03.031

8. Wittmann J., Dreiseikelmann B., Rohde C., Rohde M., Sikorski J. Isolation and characterization of numerous novel phages targeting diverse strains of the ubiquitous and opportunistic pathogen Achromobacter xylosoxidans // PLoS One. 2014. Vol. 9, № 1. Article number: e86935. doi: 10.1371/journal.pone.0086935

9. Стрелкова Д.А., Рачина С.А., Кулешов В.Г., Бурмистрова Е.Н., Сычев И.Н., Ананичева Н.А., Васильева Ю.Ю., Чуркина Е.А. Микробиологический мониторинг пациентов с COVID-19 в ОРИТ : проспективное наблюдательное исследование // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022. Т. 24, № 3. С. 274–282. doi: 10.36488/cmac.2022.3.274-282

10. Gomez-Cerezo J., Suarez I., Rios J.J., Pena P., Garcia de Miguel M.J., de Jose M., Monteagudo O., Linares P., Barbado-Cano A., Vázquez J.J. Achromobacter xylosoxidans bacteremia: a 10-year analysis of 54 cases // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2003. Vol. 22, № 6. P. 360–363. doi: 10.1007/s10096-003-0925-3

11. Marion-Sanchez K., Pailla K., Olive C., Le Coutour X., Derancourt C. Achromobacter spp. healthcare associated infections in the French West Indies: a longitudinal study from 2006 to 2016 // BMC Infect. Dis. 2019. Vol. 19, № 1. Article number: 795. doi: 10.1186/s12879-019-4431-3

12. Liu C., Guo J., Yan W., Jin Y., Pan F., Fang X., Qin L., Liu C. Hospital-acquired pneumonia due to Achromobacter xylosoxidans in the elderly: a single-center retrospective study in Beijing // J. Infect. Dev. Ctries. 2017. Vol. 11, № 1. P. 10–18. doi: 10.3855/jidc.8747

13. Боронина Л.Г., Кочнева Н.А., Саматова Е.В., Асновская А.Г., Устюгова С.С., Панова С.А. Сравнительная характеристика бактериальных патогенов, выделенных от пациентов реанимационных отделений детского стационара // Клиническая лабораторная диагностика. 2024. Т. 69, № 5. С. 215–221. doi: 10.51620/0869-2084-2024-69-5-215-221

14. Pérez Barragán E., Sandino Pérez J., Corbella L., Orellana M.A., Fernández-Ruiz M. Achromobacter xylosoxidans bacteremia: clinical and microbiological features in a 10-year case series // Rev. Esp. Quimioter. 2018. Vol. 31, № 3. P. 268–273. PMID: 29806765.

15. Карноух К.И., Дроздов В.Н., Ших Е.В., Жилина С.В., Лазарева Н.Б. Этиология бактериальных инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и антибиотикорезистентность основных возбудителей у пациентов, госпитализированных с COVID-19 : ретроспективный анализ // Вестник РАМН. 2022. Т. 77. № 1. С. 25–32. doi: 10.15690/vramn1552

16. Ronin E., Derancourt C., Cabié A., Marion-Sanchez K. Achromobacter spp. surgical site infections : a systematic review of case reports and case series // Microorganisms. 2021. Vol. 9, № 12. Article number: 2471. doi: 10.3390/microorganisms9122471

17. Воронина О.Л., Кунда М.С., Рыжова Н.Н., Аксенова Е.И., Семенов А.Н., Лазарева А.В., Семыкин С.Ю., Амелина Е.Л., Симонова О.И., Красовский С.А., Лунин В.Г., Баранов А.А., Чучалин А.Г., Гинцбург А.Л. Разнообразие и опасность Achromobacter spp., поражающих дыхательные пути больных муковисцидозом // Пульмонология. 2015. Т. 25, № 4. С. 389–402. doi: 10.18093/0869-0189-2015-25-4-389-402

18. Чернуха М.Ю., Аветисян Л.Р., Шагинян И.А. Алексеева Г.В., Авакян Л.В., Каширская Н.Ю., Капранов Н.И., Семыкин С.Ю., Сиянова Е.А., Медведева О.С., Красовский С.А., Усачева М.В., Кондратьева Е.И., Амелина Е.Л., Чучалин А.Г., Гинцбург А.Л. Алгоритм микробиологической диагностики хронической инфекции легких у больных муковисцидозом // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2014. Т. 16, № 4. С. 312–324. EDN: TBSQPF.

19. Поликарпова С.В., Жилина С.В., Кондратенко О.В., Лямин А.В., Борзова Ю.В., Жестков А.В. Руководство по микробиологической диагностике инфекций дыхательных путей у пациентов с муковисцидозом. Тверь: Триада, 2019. 128 с. ISBN 978-5-94789-905-4.

20. Чернуха М.Ю., Шагинян И.А., Жуховицкий В.Г. Аветисян Л.Р., Кулястова Д.Г., Сиянова Е.А., Медведева О.С, Поляков Н.Б., Соловьев А.И., Грумов Д.А., Кондратьева Е.И., Каширская Н.Ю., Капранов Н.И., Шерман В.Д., Воронкова А.Ю., Никонова В.С., Амелина Е.Л., Красовский С.А., Усачева М.В. Применение системы MALDI Biotyper и алгоритма микробиологической диагностики для идентификации неферментирующих микроорганизмов, выделенных из дыхательных путей у больных муковисцидозом // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2017. Т. 19, № 4. С. 327–334. EDN: YQCYLF.

21. Чернуха М.Ю., Аветисян Л.Р. Микробиологическая диагностика при лёгочных заболеваниях // Респираторная медицина : руководство : в 4 т. / под ред. А.Г. Чучалина. М.: ПульмоМедиа; 2024. Т. 1. С. 394–414. doi: 10.18093/987-5-6048754-9-0-2024-1-394-414

22. Peltroche-Llacshuanga H., Kentrup H., Haase G. Persistent airway colonization with Alcaligenes xylosoxidans in two brothers with cystic fibrosis // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1998. Vol. 17, № 2. P. 132–134. doi: 10.1007/BF01682173. Erratum in: Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 1998. Vol. 17, № 2. Article number: 368.

23. Методики клинических лабораторных исследований : справочное пособие : в 3-х т. / под ред. В.В. Меньшикова. Т. 3. М.: ООО «Лабора», 2009. 880 с. ISBN 978-5-903284-04-7. EDN: PCUIDL.

24. Lambiase A., Catania M.R., Del Pezzo M., Rossano F., Terlizzi V., Sepe A., Raia V. Achromobacter xylosoxidans respiratory tract infection in cystic fibrosis patients // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect Dis. 2011. Vol. 30, № 8. P. 973–980. doi: 10.1007/s10096-011-1182-5

25. Воронина О.Л., Кунда М.С., Аксенова Е.И., Орлова А.А., Чернуха М.Ю., Лунин В.Г., Амелина Е.Л., Чучалин А.Г., Гинцбург А.Л. Экспресс-диагностика микроорганизмов, поражающих дыхательные пути больных муковисцидозом // Клиническая лабораторная диагностика. 2013. Т. 11. C. 53–58. EDN: RTXKAZ.

26. Guss A.M., Roeselers G., Newton I.L., Young C.R., Klepac-Ceraj V., Lory S., Cavanaugh C.M. Phylogenetic and metabolic diversity of bacteria associated with cystic fibrosis // ISME J. 2011. Vol. 5, № 1. P. 20–29. doi: 10.1038/ismej.2010.88

27. Spilker Т., Vandamme P., Lipuma J.J. Identification and distribution of Achromobacter species in cystic fibrosis // J. Cyst. Fibros. 2013. Vol. 12. № 3. P. 298–301. doi: 10.1016/j.jcf.2012.10.002

28. Способ идентификации бактерий Achromobacter xylosoxidans: пат. 2849183 RU / авторы и заявители А.П. Бондаренко, А.О. Голубева, О.Н. Огиенко, О.Е. Троценко; патентообладатель; Федеральное бюджетное учреждение науки «Хабаровский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; заявл. 08. 10. 2024; опубл. 23. 10. 2025.